是的，企业需要了解是否可以与该写字楼签订保密协议以保护企业的商业机密。企业的商业机密是企业的核心竞争力和商业利益的重要保障，在与写字楼签订保密协议之前，企业需要了解相关法律规定和协议条款。

首先，企业需要了解相关法律法规对于保密协议的规定和要求。在签订保密协议前，企业需要了解相关的法律法规，如《合同法》、《反不正当竞争法》等，以明确自己的权利和义务。

其次，企业需要了解该写字楼的保密协议条款和条件。有些写字楼可能会要求企业在签订租赁协议的同时签订保密协议，企业需要了解协议的具体内容和条款，以确保自己的商业机密得到保护。

此外，企业还需要了解保密协议的违约后果和责任。在签订保密协议前，企业需要了解如果违反协议需要承担的违约后果和责任，以便做出最合适的决策。

总之，企业在选择写字楼时需要了解是否可以与该写字楼签订保密协议以保护企业的商业机密，并了解相关法律法规和协议条款，以便做出最合适的决策。